Tarımsal Topraklardan İzole Edilen Bazı Hypocreales Üyelerinin Moleküler Teşhisi ve Filogenisi

Abstract

Hypocreanlean mantarları Dünya'dak öneml b tk patojenler d r. Bu türler n sebep olduğu baş tahr bat ve tahıl hasar hastalığı, tohum kal tes nde azalma ve tahılın m kotoks nler le bulaşması neden yle büyük ekonom k kayıplardan sorumludur. Morfoloj k ve b yok myasal testler hala temel olsa da, bu mantarların moleküler teşh s ne yönel m g derek artmaktadır. Bu makale, Esk şeh r'dek tarım topraklarından zole ed lm ş olan Hypocreanlean mantarlarının PCR le dent f kasyonunu ncelemekted r. B onectr a, Fusar um, G bberella ve Nectr a olmak üzere 4 farklı c nse a t 5 Hypocreanlean mantarı 56 farklı toprak numunes nden zole ed lm şt r. Bu suşların DNA'sı, cam boncuklar ve vorteks ekstraks yon yöntem le zole ed lm ş ve ün versal fungal spes f k pr merler le PCR ampl f kasyonu ç n kullanılmıştır. Fungal r bozomal DNA'nın (rDNA) ç transkr ps yonlu ayırıcı (ITS) bölgeler , CEQ 8000 Genet k Anal z S stem le d z lenm şt r. Bu çalışmada elde ed len ITS-5.8S d z ler , GenBank ver tabanında depolanan d z lerle karşılaştırılmıştır. İncelenen b rb r ne yakın akraba Hypocreanlean mantarlarının f logenet k konumu bel rlenm şt r

Hypocreanlean fungi are include important plant pathogens around the world. Head blight and crown rot disease of cereals caused by these species are responsible for large economic losses due to reduction in seed quality and contamination of grain with their mycotoxins. Although morphological and biochemical tests are still fundamental there is an increasing more towards molecular diagnostics of these fungi. This paper reviews to PCR identification of Hypocreanlean fungi isolated from agricultural soil from Eskisehir City. Five Hypocreanlean fungi belong to 4 different genera as Bionectria, Fusarium, Gibberella and Nectria were isolated from 56 soil samples. DNA of these strains were isolated by glass beads and vortexing extraction method and used for PCR amplification with universal fungal specific primers. The internal transcribed spacer (ITS) regions of fungal ribosomal DNA (rDNA) were sequenced by CEQ 8000 Genetic Analysis System. The ITS-5.8S sequences obtained in this study were compared with those deposited in the GenBank Database. Phylogenetic position of investigated closely related Hypocreanlean fungi was determined